Atualmente, João Almeida é Conselheiro Sénior na Hakluyt, sendo especializado em assuntos europeus e de risco político e geopolítico.

Anteriormente, entre 2006 e 2012, João Almeida serviu como Assessor Político ao Presidente da Comissão Europeia, José Manuel Durão Barroso. De 1999 a 2006, João Almeida atuou como Conselheiro Sénior e, posteriormente, como Diretor Executivo do Instituto de Defesa Nacional, em Portugal.

João Almeida possui um MA em Assuntos e Relações Internacionais pela Universidade de Kent e é doutorado em Filosofia pela London School of Economics and Political Science (LSE).

João Almeida é membro do Conselho da Diáspora Portuguesa desde julho de 2023.